在行政程序方面，常見風險包括同意備案逾期、租賃期程違規，以及權限過於集中或審查標準不透明等情形。這些問題往往會增加人為干預與黑箱操作的空間。因此建議建立「綠能透明專區」，公開申請流程、審查重點與案件進度，強化外部監督，同時透過跨部門專案審查機制，避免關鍵流程由單一承辦或主管主導。程序越透明，人為干預的空間就越小。